1-33-15(016上22L) おとーとが、 → おとーとが

1-34- 8(016下5L) ちょっとすぎに → ちょっと□すぎに
点ナビ「数5ジ■チョット■スギ	」「チョット■スギ」

1-40- 7(018上14L) わかく□して → わかくして
「して」は助詞だと思う。

1-49-11(020下12L) ながい□こと、 → ながい□こと

1-81-15(029下1L) □□しかも → □□「しかも

1-87-13(031上10L) あんたが、 → あんたが

2-55-13 ならんだ、□ひとつの → ならんだ□ふたつの

○主観的な意見（適当にスルーしてください）
1-53- 7(021下14L) まずまず → まず□まず
単独でも意味が通じる

1-68- 5(025下15L) 「ありがとざいます」 → 「ありがと//ざいます」
どっちでも良いような気がしますが、私だったら切りたい。

1-77-13(028上19L) １まい□かんで → いちまい□かんで
広辞苑　�C（副詞的に用いて）一段階。「―上手(うわて)」
と同じ用法で、「母が一段落かんでいる」ではないかと。
点ナビ「イチマイ■ウワテ」

2-14-16 きんぞくもー → きんぞくあみ
単純に分かりやすい読み方という理由。

2-37-3(042下18L) ５（ふぁいぶ） → ふぁいぶ（５）
2-37-４(042下19L) 「５」 → 「ふぁいぶ」
2-37-5(042下19L) ＰＳ　３と → ＰＳ スリーと
ゲームに詳しくないですが、バージョンを英数字で発音しているような気がします。
2-37-10(042下23L)では「ふぁいぶ」と点訳しているので、英語読みに統一したらどうでしょう。
ただし、３にはルビがないので迷いますが。

2-49-17-・2-54-9 へいげん → ひらはら
漢字説明が「へいげん」なのは、それが多くの人に通じる読み方だからで、実際は「へいげん」以外の読み方だろうと推測しました。

2-53-12 うわ□うわ →うわうわ
造語っぽいですが擬声語なので。

2-58-10 ふちの → へりの
「ガラス鉢のふち」ではなく、「下駄箱(の上面)のへり」だと思いました。（主語はドライフラワーですけど）

2-62-2・2-64-4　生者
ネット上には「せいじゃ」もありましたが、手持ちの5冊では、
広辞苑「しょうじゃ」「せいしゃ」
大辞林「しょうじゃ」「せいしゃ」
明鏡「せいしゃ」
生者「しょうじゃ」
新潮国語「しょうじゃ」「せいしゃ」
なので辞書的には「しょうじゃ」または「せいしゃ」とするのが正解かも。でも、小説なので好みで。

2-78- 3　「ともだちに〜〜わかりあえるさ」
2-78-10　「いままで〜〜君と」
2-78-13　「これから〜〜君と――」
以上３箇所は歌詞なので、原本のマスあけは行替えだと思います。
（紙に書いてあるわけじゃないですが）
なので、2マスあけまたは詩行符を使う方法もありだと思いました。